菌類在生物中為調查較少的，約有近七萬種被描述過( Hawksworth， 1991 ) 。然而世界上所存在的菌類到底有多少，過去並沒有較精確的評估。Martin ( 1951 )認為菌類的種數約略同於維管束植物，因此估計有二十六萬種。一直到Hawksworth ( 1991 )提出了菌類種數的革命性估計， 此豐富的菌類多樣性遂更加引起生物學家的重視。Hawksworth 經廣泛的分析與討論，保守地推估出世界上應有一百五十萬種的菌類，而已知的種類竟不到百分之五。這項估計已廣為生物學者所視為合理，並被普遍引用。Hawksworth的估計根基於對於一個調查較詳細的地區(如英國)的維管束植物與菌類種數的比例為1：6由世界上維管束植物如有二十七萬種，推估真菌有一百五十萬種。然而這樣的推論恐有疑問，因菌類的散布能力是較維管束植物要強得多，也就是說不同地區(如中國與美國)間的共同種比率，維管束植物要遠低於菌類。因此如由一地區的調查擴大到全世界的範圍，菌類對維管束植物的種數比應該會有大幅度的降低。即使如此， Hawksworth 的估計仍有其可能性，就如他文中所提的幾個理由說明此估計仍是相當保守的：( 1 )全世界的維管束植物有可能還多於二十七萬種，如此則菌類的估計種數亦當隨之增加；( 2 )世界上多達數百萬種以上的昆蟲，其中許多有共生或寄生的菌類，而這些菌類多數仍未被調查出；( 3 )許多在特殊棲所生活的菌類的調查仍不多。

臺灣的維管束植物約有四千種( Li et a1., 1979) ，菌類種數如以六倍計，約有二萬四千種。臺灣菌類已知有四千多種(陳瑞青， 1992) ，調查程度可能只達到現存六分之一的種數。因此就菌類多樣性研究而言，種類的調查應是首要的，而加強菌種的收集保存是當今急迫性的工作。國內菌類學者及年輕學子實應投入更多心力，協同力量，加快腳步去調查此一豐富的生物資源。